In der inhaltlichen Arbeit ist die DWA in zehn Hauptausschüssen mit insgesamt mehr als 350 Fachausschüssen und Arbeitsgruppen organisiert. Der Hauptausschuss "Entwässerungssysteme" deckt dabei die gesamte Thematik der Entwässerung inkl. Misch- und Regenwasserbehandlung ab, angefangen von konzeptionellen Lösungsansätzen, über den Bau und Betrieb von Entwässerungsanlagen jeglicher Art, bis hin zu ihrer Überwachung und Sanierung. Auch alle zugehörigen Softwarethemen, wie z.B. Kanalinformationssysteme, Abfluss- und Schmutzfrachtsimulationen, Messdatenmanagementsysteme, Betriebsführungssysteme sowie Verfahren zur Zustandsbewertung von Kanälen und Schächten sind dort angesiedelt.
Herr Dr.-Ing. Klaus Hans Pecher folgt als stellvertretender Vorsitzender Herrn Prof. Dr.-Ing. Theo G. Schmitt von der Technischen Universität Kaiserslautern, der das Amt aus Altersgründen aufgibt. Dr. Pecher ist innerhalb des Hauptausschusses außerdem weiterhin Obmann des Fachausschusses ES-1 "Grundsatzfragen/Anforderungen".